本剧改编自同名漫画，讲述了因长着娃娃脸而自卑的大学生·樱庭唯纯被误认为未成年人，被警察天泽教育。唯纯给天泽看了学生证，才得以幸免，但后来在打工的便利店与天泽再次相遇。刚到附近派出所赴任的天泽成了便利店的常客，每次见到唯纯都会问他要不要吃夜宵……。对于这种亲昵的态度，唯纯一边觉得他“真是个混蛋”，一边担心他的饮食生活，不由得说“我去做饭给你吃吧？”为了亲自下厨而去了天泽的家——！？...

「超能力開發研究所」突然遭到無數不明生命體的攻擊，研究所已經完全被破壞殆盡。混亂中，原本在研究所中被實驗的超能力者小雷(10歲)與紗綾香(12歲)趁隙逃了出來。數月之後，不明生命體的政擊再度出現，這次的目標竟然是紗綾香，翔一聞訊之後立即變身為假面騎士顎門，與G3-X一同前住救援。突然間，G4出現了，他的出現讓眾人非常驚訝。因為在兩個月前，G4的藍圖被盜，它的力量強大，但是穿戴它的人往往受不了而致命...

警方為應付未確認生命體而開發了G3系統，這套G3系統是根據未確認生命體4號即幪面超人古迦的力量而設計出來，裝著員是一位叫冰川誠的警員，為人真誠但略為粗獷。警方另一部門在荒島上發現了古代文明，並進行解碼。當未確認生命體再次出現，連G3也不是其對手時，神秘的金色幪面超人亞極陀登場，這個幪面超人是一位失憶的青年津上翔一變身，起初因未能控制而襲擊G3。翔一暫住在美杉義彥的家，認識了擁有超能力的風谷真魚...