某日，小新（矢岛晶子 配音）、小葵和美伢（楢桥美纪 配音）被一群神秘人物绑架，醒来之后发现身处一间神秘的基地之内，原来，这里是名为“温泉G组”的秘密组织，意在保护对于日本来说十分珍贵的温泉。然而，横空出世的污垢达人博士（家弓家正 配音）企图利用“地球温泉计划”将温泉G组彻底击垮。唯一能够阻止污垢达人博士的阴谋的，就只有仅存在于传说之中的“黄金之魂温泉”，而组员们经过调查，发现该温泉正好处于小新...

永禄9年（1566），适值日本战国时代，8名落魄武士逃到某山村，从此解甲归田，过起普通农夫的生活。不久，毛利一族追查藏匿武士，村民庄左卫门（桥本功 饰）设计将武士们杀害。武士临死前放下诅咒，陷害他们之人必死于非命。在此之后，诅咒应验，包括庄左卫门在内8人死亡，村子也改名为八墓村。昭和24年，在东京担任飞机领航员的寺田辰弥（萩原健一 饰）突然得知自己竟是冈山县八墓村大家族多治见家的孩子，时当主多治见...